东南大学苏州研究院是东南大学和苏州市人民政府全面合作共建，集科技创新载体建设、高新技术企业孵化、高层次人才培养、公共技术服务等多功能为一体的办学实体。2005年10月，东南大学与苏州市人民政府签署了《东南大学—苏州市人民政府全面合作协议》，成立东南大学苏州研究院。

东南大学苏州研究院坐落在苏州工业园区风光秀美、景致典雅的独墅湖科教创新区，占地面积6.67公顷，总建筑面积约为6.3万平方米，建设总投资2.5亿余元。